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Genetic polymorphism of αS1 casein in Guéra and Sahel goat

Published online by Cambridge University Press:  11 April 2014

D. Traoré ,
Y. Sanogo ,
R. Fané ,
A. Touré ,
O. Cissé  and
A.H. Babana
D. Traoré*
Affiliation:
Laboratoire de Recherche en Microbiologie et biotechnologie Microbienne (LaboREM-biotech), Faculté des Sciences et Techniques (FST), Université des Sciences, des Techniques et des Technologies de Bamako (USTTB), Mali
Y. Sanogo
Affiliation:
Laboratoire de Recherche en Microbiologie et biotechnologie Microbienne (LaboREM-biotech), Faculté des Sciences et Techniques (FST), Université des Sciences, des Techniques et des Technologies de Bamako (USTTB), Mali
R. Fané
Affiliation:
Laboratoire de Recherche en Microbiologie et biotechnologie Microbienne (LaboREM-biotech), Faculté des Sciences et Techniques (FST), Université des Sciences, des Techniques et des Technologies de Bamako (USTTB), Mali
A. Touré
Affiliation:
Laboratoire de Recherche en Microbiologie et biotechnologie Microbienne (LaboREM-biotech), Faculté des Sciences et Techniques (FST), Université des Sciences, des Techniques et des Technologies de Bamako (USTTB), Mali
O. Cissé
Affiliation:
Laboratoire de Recherche en Microbiologie et biotechnologie Microbienne (LaboREM-biotech), Faculté des Sciences et Techniques (FST), Université des Sciences, des Techniques et des Technologies de Bamako (USTTB), Mali
A.H. Babana
Affiliation:
Laboratoire de Recherche en Microbiologie et biotechnologie Microbienne (LaboREM-biotech), Faculté des Sciences et Techniques (FST), Université des Sciences, des Techniques et des Technologies de Bamako (USTTB), Mali
*
Correspondence to: D. Traore, Laboratoire de Recherche en Microbiologie et biotechnologie Microbienne (LaboREM-biotech), Faculté des Sciences et Techniques (FST), Université des Sciences, des Techniques et des Technologies de Bamako (USTTB), Mali. email: dtraore@laborem-biotech.com
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Summary

The αS1 casein gene is one of the lacto protein genes, which are involved in the milk synthesis. The objective of this study was to identify genotypes of B and E alleles at the locus αS1 casein in the Guéra and Sahel goat herds in Mali. These herds were located in the Regional Center of Agronomic Research and the Ségala village in Kayes, Mali. A total of 101 blood samples (53 for Guéra goat and 48 for Sahel goats) were collected and analysed. Alleles B and/or E, located on exon 19, of the αS1 casein gene were amplified using allele specific amplification polymerase chain reaction and analysed using 2 percent agarose gel electrophoresis. Results from this analysis identified three genotypes: BB, BE and EE with frequencies 0.77, 0.17 and 0.06 for the Guéra goats. However, only the BB genotype was identified in the Sahel goats. The frequencies of alleles B and E in the Guéra goats were 0.86 and 0.14, respectively, with an observed and expected heterozygotes of 0.08 and 0.12, respectively.

Résumé

Le gène αS1 caséine fait partie du groupe de gène des lactoprotéines intervenant dans la synthèse du lait. L'objectif de notre travail était d'identifier les génotypes liés aux allèles B et E au locus αS1 caséine chez deux races caprines, la chèvre Guéra et du Sahel au Mali. Les analyses ont porté sur le gène αS1 caséine d'un troupeau de chèvre Guéra du Centre Régional de Recherche Agronomique de Kayes au Mali et d'un autre troupeau, la chèvre du Sahel en milieu rural dans un village (Ségala) près de Kayes au Mali. Des amorces spécifiques ont été utilisées pour l'identification des allèles B et/ou E du gène αS1 caséine (exon 19). Au total, 101 échantillons de sang (53 de la chèvre Guéra et 48 de la chèvre du Sahel) ont été prélevés et le gène αS1 caséine a été amplifié par la méthode de l'allèle spécifique polymerase chain reaction (AS-PCR). La révélation des allèles a été faite après électrophorèse sur un gel d'agarose 2 percent en utilisant le bromure d'éthidium. Trois génotypes, (BB, BE et EE) avec des fréquences respectives de 0,77; 0,17 et 0,06 ont été observés chez la chèvre Guéra. En revanche, un seul génotype (BB) a été identifié chez la chèvre du Sahel. Les fréquences des allèles B et E au niveau du troupeau Guéra étaient respectivement 0,86 et 0,14. L'hétérozygotie observée et attendue était de 0,08 et 0,12.

Resumen

El gen de la caseína αS1 es uno de los genes, codificantes para proteínas lácteas, implicados en la síntesis de la leche. El objetivo de este estudio era identificar los genotipos de los alelos B y E del locus de la caseína αS1 en los rebaños de cabras Guéra y Sahel de Malí. Estos rebaños se encontraban en el Centro Regional de Investigación Agronómica y en el pueblo de Ségala, en la región de Kayes de Malí. Se tomaron y se analizaron un total de 101 muestras de sangre (53 de cabras Guéra y 48 de cabras Sahel). Los alelos B y/o E, situados en el exón 19, del gen de la caseína αS1 fueron amplificados de forma específica usando la reacción en cadena de la polimerasa y analizados por electroforesis en gel de agarosa (2%). Los resultados de este análisis permitieron identificar tres genotipos: BB, BE y EE, con unas frecuencias de 0,77, 0,17 y 0,06 para las cabras Guéra. Sin embargo, tan sólo el genotipo BB fue identificado en las cabras Sahel. Las frecuencias de los alelos B y E en las cabras Guéra fueron de 0,86 y 0,14 respectivamente, con una heterocigosis observada y esperada de 0,08 y 0,12, respectivamente.

Keywords

alleleαS1 caseinGuéra goatSahel goatallèlesαS1 caséinechèvre Guérachèvre du Sahelalelocaseína αS1cabra Guéracabra Sah
Type
Research Article
Information
Animal Genetic Resources/Resources génétiques animales/Recursos genéticos animales , Volume 54 , June 2014 , pp. 79 - 83
Copyright
Copyright © Food and Agriculture Organization of the United Nations 2014 

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References

Angiolillo, A., Yahyaoui, M.H., Sanchez, A., Pilla, F. & Folch, J.M. 2002. Characterization of a new genetic variant in the caprine κ-casein gene. Journal of Dairy Science 85: 2679–2680.Google Scholar
Barbieri, M.E., Manfredi, E., Elsen, J.M., Ricordeau, G., Bouillon, J., Grosclaude, F., Mahe, M.F. & Bibe, B. 1995. Effet du locus de la caséine alpha S1 sur les performances laitières et les paramètres génétiques des chèvres Alpines. Genetic Selection Evolution 27: 437–450.CrossRefGoogle Scholar
Boulanger, A., Grosclaude, F. & Mahe, M.F. 1984. Polymorphisme des caséines α s1 et α s2 de la chèvre (Capra hircus). Genetic Selection Evolution 16: 157–176.Google Scholar
Caroli, A., Chiatti, F., Chessa, S., Rignanese, D., Ibeagha-awemu, E.M. & Erhardt, G. 2007. Characterization of the casein gene complex in West African goats and description of a new αs1-casein polymorphism. Journal of Dairy Science 90: 2989–2996.Google Scholar
Cisse, M., Fall, Y. & ly, I. 2005. Performances laitières et état nutritionnel des chèvres du Sahel conduites sur parcours naturels: relations avec la croissance des chevreaux. In Proceedings of the Third Biennial Conference of the African Small Ruminant Research Network – UICC, Kampala, Uganda, 5–9 December y1994.Google Scholar
Feligini, M., Frati, M., Cubrik, V.C., Brambilla, A., Parma, P., Curik, I., Greppi, G.F. & Enne, G. 2005. Caprine alpha S1 casein polymorphism, characterization of A, B, E and F variants by means of various biochemical and molecular techniques. Food Technology Biotechnology 43(2): 123–132.Google Scholar
Grosclaude, F., Mahe, M.F., Brignon, G., Di stasio, I. & Jeunet, R. 1987. A Mendelian polymorphism underlying quantitative variations of goat αs1 casein. Genetic Selection Evolution 19(4): 399–412.Google Scholar
Jordana, J., Amills, M., Diaz, E., Angulo, C., Serradilla, J.M. & Sanchez, A. 1996. Gene frequencies of caprine αS1-casein polymorphism in Spanish goat breeds. Small Ruminant Research 20: 215–221.Google Scholar
Martin, P. 1993. Polymorphisme génétique des lactoprotéines caprines. Lait 73: 511–532.Google Scholar
Missohou, A., Talaki, E. & Maman Laminou, I. 2006. Diversity and genetic relationships among seven West African goat breeds. Asian-Australasian Journal of Animal Sciences 19(9): 1245–1251.Google Scholar
Nantoumé, H., Traoré, D. & Diarra, C.H.T. 2005. Mise au point de techniques d'amélioration des productions de lait, de viande et de laine des petits ruminants. Rapport final de Recherche, 11e Commission Scientifique du Comité National de Recherche Agricole, Novembre 2005, Bamako.Google Scholar
Ramunno, L., Longobardi, E., Pappalardo, M., Rando, A., Di Gregorio, P., Cosenza, G., Mariani, P., Pastore, N. & Masina, P. 2001. An allele associated with a non-detectable amount of alpha S2 casein in goat milk. Animal Genetics 32: 19–26.Google Scholar
Soares, M.A.M., Rodrigues, M.T., Mognol, G.P., Ribeiro, L.F.C., Silva, J.L.C. & Brancalhão, R.M.C. 2009. Polymorphism of alphas1-casein gene in a dairy goat herd in the southeastern region of Brazil. Revista Brasileira de Zootecnia 38(6).CrossRefGoogle Scholar
Traoré, D., Nantoumé, H. & Diarra, C.H.T. 2005. Amélioration de la production laitière par l'introduction de la chèvre Guéra. Rapport final de Recherche, 11e Commission Scientifique du Comité National de Recherche Agricole, Novembre 2005, Bamako.Google Scholar
Traoré, D., Nantoumé, H. & Diarra, C.H.T. 2007. La chèvre Guéra. Institut du Sahel; les Monographies Sahéliennes ISBN: 2-912693-48-9.Google Scholar
Truett, G.E., Heeger, P., Mynett, R.L., Truett, A.A., Walken, T.A. & Warmen, M.L. 2000. Preparation of PCR quality mouse genomic DNA with hot sodium and tris (Hotshot). Biotechnics 29(1): 52–54.CrossRefGoogle ScholarPubMed
Vacca, G.M., Ouled Ahmed Ben Ali, H., Carcangiu, V., Pazzola, M. & Dettori, M.L. 2009. Genetic structure of the casein gene cluster in tne Tunisian native goat breed. Small Ruminant Research 87(1): 33–38.Google Scholar