Les bactéries du fer isolées des eaux et des sédiments du Sud-Ouest de la France sont soit autotrophes (g. Gallionella), soit hétérotrophes (g. Sphaerotilus, Crenothrix, Siderocapsa, etc...). Les premières sont inféodées à la présence de fer ferreux, alors que les secondes occupent des niches écologiques plus variées, quoique toujours aux limites de stabilité du fer ferreux dans les eaux. Ce dernier point, joint à leur exigence en matière organique, facteur de mobilisation du fer, explique leur rôle dans le colmatage biologique des drains. De plus, il est probable que l'influence des ferrobactéries déborde largement le cadre du cycle du fer.