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Genetic polymorphism of αS1 casein in Guéra and Sahel goat

Published online by Cambridge University Press:  11 April 2014

D. Traoré ,
Y. Sanogo ,
R. Fané ,
A. Touré ,
O. Cissé  and
A.H. Babana
D. Traoré*
Affiliation:
Laboratoire de Recherche en Microbiologie et biotechnologie Microbienne (LaboREM-biotech), Faculté des Sciences et Techniques (FST), Université des Sciences, des Techniques et des Technologies de Bamako (USTTB), Mali
Y. Sanogo
Affiliation:
Laboratoire de Recherche en Microbiologie et biotechnologie Microbienne (LaboREM-biotech), Faculté des Sciences et Techniques (FST), Université des Sciences, des Techniques et des Technologies de Bamako (USTTB), Mali
R. Fané
Affiliation:
Laboratoire de Recherche en Microbiologie et biotechnologie Microbienne (LaboREM-biotech), Faculté des Sciences et Techniques (FST), Université des Sciences, des Techniques et des Technologies de Bamako (USTTB), Mali
A. Touré
Affiliation:
Laboratoire de Recherche en Microbiologie et biotechnologie Microbienne (LaboREM-biotech), Faculté des Sciences et Techniques (FST), Université des Sciences, des Techniques et des Technologies de Bamako (USTTB), Mali
O. Cissé
Affiliation:
Laboratoire de Recherche en Microbiologie et biotechnologie Microbienne (LaboREM-biotech), Faculté des Sciences et Techniques (FST), Université des Sciences, des Techniques et des Technologies de Bamako (USTTB), Mali
A.H. Babana
Affiliation:
Laboratoire de Recherche en Microbiologie et biotechnologie Microbienne (LaboREM-biotech), Faculté des Sciences et Techniques (FST), Université des Sciences, des Techniques et des Technologies de Bamako (USTTB), Mali
*
Correspondence to: D. Traore, Laboratoire de Recherche en Microbiologie et biotechnologie Microbienne (LaboREM-biotech), Faculté des Sciences et Techniques (FST), Université des Sciences, des Techniques et des Technologies de Bamako (USTTB), Mali. email: dtraore@laborem-biotech.com
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Summary

The αS1 casein gene is one of the lacto protein genes, which are involved in the milk synthesis. The objective of this study was to identify genotypes of B and E alleles at the locus αS1 casein in the Guéra and Sahel goat herds in Mali. These herds were located in the Regional Center of Agronomic Research and the Ségala village in Kayes, Mali. A total of 101 blood samples (53 for Guéra goat and 48 for Sahel goats) were collected and analysed. Alleles B and/or E, located on exon 19, of the αS1 casein gene were amplified using allele specific amplification polymerase chain reaction and analysed using 2 percent agarose gel electrophoresis. Results from this analysis identified three genotypes: BB, BE and EE with frequencies 0.77, 0.17 and 0.06 for the Guéra goats. However, only the BB genotype was identified in the Sahel goats. The frequencies of alleles B and E in the Guéra goats were 0.86 and 0.14, respectively, with an observed and expected heterozygotes of 0.08 and 0.12, respectively.

Résumé

Le gène αS1 caséine fait partie du groupe de gène des lactoprotéines intervenant dans la synthèse du lait. L'objectif de notre travail était d'identifier les génotypes liés aux allèles B et E au locus αS1 caséine chez deux races caprines, la chèvre Guéra et du Sahel au Mali. Les analyses ont porté sur le gène αS1 caséine d'un troupeau de chèvre Guéra du Centre Régional de Recherche Agronomique de Kayes au Mali et d'un autre troupeau, la chèvre du Sahel en milieu rural dans un village (Ségala) près de Kayes au Mali. Des amorces spécifiques ont été utilisées pour l'identification des allèles B et/ou E du gène αS1 caséine (exon 19). Au total, 101 échantillons de sang (53 de la chèvre Guéra et 48 de la chèvre du Sahel) ont été prélevés et le gène αS1 caséine a été amplifié par la méthode de l'allèle spécifique polymerase chain reaction (AS-PCR). La révélation des allèles a été faite après électrophorèse sur un gel d'agarose 2 percent en utilisant le bromure d'éthidium. Trois génotypes, (BB, BE et EE) avec des fréquences respectives de 0,77; 0,17 et 0,06 ont été observés chez la chèvre Guéra. En revanche, un seul génotype (BB) a été identifié chez la chèvre du Sahel. Les fréquences des allèles B et E au niveau du troupeau Guéra étaient respectivement 0,86 et 0,14. L'hétérozygotie observée et attendue était de 0,08 et 0,12.

Resumen

El gen de la caseína αS1 es uno de los genes, codificantes para proteínas lácteas, implicados en la síntesis de la leche. El objetivo de este estudio era identificar los genotipos de los alelos B y E del locus de la caseína αS1 en los rebaños de cabras Guéra y Sahel de Malí. Estos rebaños se encontraban en el Centro Regional de Investigación Agronómica y en el pueblo de Ségala, en la región de Kayes de Malí. Se tomaron y se analizaron un total de 101 muestras de sangre (53 de cabras Guéra y 48 de cabras Sahel). Los alelos B y/o E, situados en el exón 19, del gen de la caseína αS1 fueron amplificados de forma específica usando la reacción en cadena de la polimerasa y analizados por electroforesis en gel de agarosa (2%). Los resultados de este análisis permitieron identificar tres genotipos: BB, BE y EE, con unas frecuencias de 0,77, 0,17 y 0,06 para las cabras Guéra. Sin embargo, tan sólo el genotipo BB fue identificado en las cabras Sahel. Las frecuencias de los alelos B y E en las cabras Guéra fueron de 0,86 y 0,14 respectivamente, con una heterocigosis observada y esperada de 0,08 y 0,12, respectivamente.

Keywords

alleleαS1 caseinGuéra goatSahel goatallèlesαS1 caséinechèvre Guérachèvre du Sahelalelocaseína αS1cabra Guéracabra Sah
Type
Research Article
Information
Animal Genetic Resources/Resources génétiques animales/Recursos genéticos animales , Volume 54 , June 2014 , pp. 79 - 83
Copyright
Copyright © Food and Agriculture Organization of the United Nations 2014 

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