La Croix-Rouge du Nigéria remonte à l'année 1917, lorsque le pays était encore sous protectorat britannique. Cette année-là, la Croix-Rouge britannique avait organisé pour la première fois une activité de collecte de fonds à Lagos. Celle-ci fut suivie de la création de ce qui était alors connu sous le nom de branche centrale nigériane de la Croix-Rouge britannique, dont le siège se trouvait à Lagos. La branche possédait des divisions dans les trois régions que comptait alors le pays — orientale, septentrionale et occidentale —, avec un siège à Enugu, Kaduna et Ibadan, respectivement. L'indépendance du Nigeria, le 1er octobre 1960, marqua la naissance de la Croix-Rouge du Nigéria après l'adoption, par le Parlement, d'une loi appelée «The Nigerian Red Cross Society Act of 1960». Aujourd'hui, la Société nationale dispose d'une branche dans chacun des trente-six États du pays, ainsi qu'à Abuja, la capitale du territoire fédéral.