Las raíces de la Cruz Roja de Nigeria datan del año 1917, cuando el país todavía se hallaba bajo la autoridad británica. Ese año, la Cruz Roja Británica organizó, por primera vez, una colecta de fondos en Lagos. Tras ese evento, se instituyó la denominada Seccion Central de Nigeria de la Cruz Roja Británica, con sede en Lagos. La sección tenía subsecciones en las entonces tres zonas del país, es decir, oriental, septentrional y occidental, con sede en Enugu, Kaduna e Ibadan, respectivamente. Con la independencia del país, el 1 de octubre de 1960, nacía la Cruz Roja de Nigeria, en virtud de una Ley del Parlamento llamada «Ley de 1960 de la Cruz Roja de Nigeria». Hoy, la Sociedad Nacional cuenta con una sección en cada uno de los 36 estados, así como en Abuja, territorio de la capital federal.